Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEIL2Q969S2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEIL2Q969S2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEIL2Q969S2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEIL2Q969S2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEIL2Q969S2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms