Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BHMTQ93088 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMTQ93088 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms