Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms