Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms