Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC4Q8WW27 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms