Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAG1Q8WVM7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms