Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC1Q8TDI8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC1Q8TDI8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms