Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms