Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms