Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP32Q8NFA0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP32Q8NFA0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP32Q8NFA0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP32Q8NFA0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP32Q8NFA0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP32Q8NFA0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP32Q8NFA0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
USP32Q8NFA0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
USP32Q8NFA0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP32Q8NFA0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP32Q8NFA0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms