Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RETREG2Q8NC44 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG2Q8NC44 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms