Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP38Q8NB14 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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