Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL34Q8N239 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms