Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIX1LQ8IVB5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIX1LQ8IVB5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms