Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNRD3Q86VQ6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms