Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT27Q7Z3Y8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT27Q7Z3Y8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms