Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MICAL3Q7RTP6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms