Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM5Q71RC9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms