Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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