Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM179Q6ZVK1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms