Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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