Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms