Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
LRRC9Q6ZRR7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRC9Q6ZRR7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms