Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms