Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ZBED9Q6R2W3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms