Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms