Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms