Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms