Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms