Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms