Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GFI1BQ5VTD9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GFI1BQ5VTD9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GFI1BQ5VTD9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GFI1BQ5VTD9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GFI1BQ5VTD9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GFI1BQ5VTD9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GFI1BQ5VTD9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GFI1BQ5VTD9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GFI1BQ5VTD9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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