Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDGFL1Q5TGJ6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms