Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms