Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms