Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3KQ59H18 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms