Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms