Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP55Q53EZ4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms