Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TBRG1Q3YBR2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms