Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HFEQ30201 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HFEQ30201 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms