Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4BQ2VIQ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4BQ2VIQ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4BQ2VIQ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4BQ2VIQ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4BQ2VIQ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4BQ2VIQ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4BQ2VIQ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4BQ2VIQ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4BQ2VIQ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KIF4BQ2VIQ3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF4BQ2VIQ3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF4BQ2VIQ3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF4BQ2VIQ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF4BQ2VIQ3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms