Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms