Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms