Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C17orf58Q2M2W7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms