Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms