Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms