Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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