Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms