Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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