Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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