Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK5Q16478 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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